Für den Fall des Löschens und Neuinstallierens des vCenter Servers würde ich empfehlen zuerst HA und DRS - sofern aktiviert - zu deaktivieren und dann die ESXi Hosts zu Trennen und und von der vCenter Verwaltung sauber zu entfernen. Ich gehe davon aus, daß keine weiteren vCenter Server abhängigen Einstellungen/Konfigurationen wie z.B. Distributed Switches usw. im Einsatz sind, dies würde dann mehr Vorarbeiten erfordern.
Auf der anderen Seite halte ich ein Backup/Restore des vCenter Servers für wesentlich einfacher. Für den Fall daß noch kein entsprechendes Backup Programm im Einsatz ist, kann z.B. das kostenlose VeeamZIP sehr gute Dienst leisten (http://www.veeam.com/de/free-vmware-esxi-backup.html)
André